Franz Pixner era nato il 20 settembre 1939 a Vernurio, frazione di Rifiano in val Passiria. Ordinato sacerdote il 28 giugno 1964 a Bolzano, dal 1964 al 1966 è stato cooperatore a Scena e a Funes. In seguito don Pixner è stato educatore al Seminario minore Johanneum di Tirolo fino al 1969. Dal 1969 al 1973 è stato cooperatore a Merano, poi fino al 1976 assistente spirituale della KJS, i giovani cattolici.
Nel 1976 don Franz Pixner è stato nominato parroco a Lagundo, incarico svolto per 22 anni. Nel 1998 è diventato parroco a Siusi e dal 2006 in aggiunta a Castelrotto, incarichi che ha mantenuto fino al 2015. Dal 2006 al 2012 è stato anche decano. Dal 2015 don Pixner ha continuato il servizio pastorale come collaboratore a Castelrotto e Siusi, in particolar modo all’Alpe di Siusi.